Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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