Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms