Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib1Q9Z0F4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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