Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam50bQ9WTJ8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms