Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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