Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hmgn5Q9JL35 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hmgn5Q9JL35 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hmgn5Q9JL35 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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