Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snap29Q9ERB0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms