Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc97Q9DBT3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc97Q9DBT3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccdc97Q9DBT3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccdc97Q9DBT3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccdc97Q9DBT3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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