Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Med27Q9DB40 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms