Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D7E4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms