Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Cldn23Q9D7D7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn23Q9D7D7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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