Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al3Q9D4U4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms