Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Sgms2Q9D4B1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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