Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syf2Q9D198 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms