Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms