Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Xrcc3Q9CXE6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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