Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms