Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ddx28Q9CWT6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ddx28Q9CWT6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ddx28Q9CWT6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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