Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms