Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms