Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpa3Q9CQ71 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpa3Q9CQ71 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpa3Q9CQ71 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpa3Q9CQ71 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpa3Q9CQ71 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpa3Q9CQ71 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpa3Q9CQ71 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpa3Q9CQ71 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms