Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms