Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b1Q99NB9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b1Q99NB9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms