Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl27Q99N92 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl27Q99N92 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl27Q99N92 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl27Q99N92 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl27Q99N92 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mrpl27Q99N92 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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