Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4dQ99N05 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Ms4a4dQ99N05 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ms4a4dQ99N05 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ms4a4dQ99N05 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms