Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms