Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TrabdQ99JY4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrabdQ99JY4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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