Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Fcho1Q8K285 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcho1Q8K285 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms