Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ubqln3Q8C5U9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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