Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Znf428Q8C1M2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf428Q8C1M2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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