Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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FarsaQ8C0C7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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