Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms