Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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