Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp49Q6P9L4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp49Q6P9L4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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