Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smchd1Q6P5D8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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