Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm4Q6IRU2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm4Q6IRU2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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