Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SspnQ62147 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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