Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms