Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms