Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms