Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms