Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Dnah12Q3V0Q1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Dnah12Q3V0Q1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Dnah12Q3V0Q1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Dnah12Q3V0Q1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Dnah12Q3V0Q1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Dnah12Q3V0Q1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Dnah12Q3V0Q1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Dnah12Q3V0Q1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Dnah12Q3V0Q1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms