Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Tmem253Q3UNB8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Tmem253Q3UNB8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tmem253Q3UNB8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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