Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms