Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms