Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Tmco5-201ENSMUST00000028834 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Cst10-203ENSMUST00000109939 606 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fam117bQ3U3E2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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