Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U1D9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Q3U1D9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U1D9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Q3U1D9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Q3U1D9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Q3U1D9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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