Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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