Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq1Q0P5X1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms