Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MitfQ08874 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms